Después de los acuerdos entre los 8 equipos que clasificaron a la Liguilla quedaron definidos los horarios para los cuartos de final del Apertura 2016, los cuales destacan por el Clásico Nacional entre América y Chivas, una vez más, en este 2016.
A diferencia de otros años en que los representantes de los clubes se reunían en la Federación Mexicana de Futbol en la Ciudad de México, esta vez las negociaciones se dieron mediante videoconferencias para evitar el viaje a Toluca, sede de las nuevas instalaciones del organismo.